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環孢(bāo)子(zǐ)蟲(chóng)探(tàn)針法熒光(guāng)定量PCR的(dí)原(yuán)理(lǐ)是(shì)什(shí)麼(mó)
環孢(bāo)子蟲探針法熒(yíng)光定(dìng)量(liáng)PCR(qPCR)的(dí)核心(xīn)原(yuán)理基(jī)於(yú)TaqMan探(tàn)針(zhēn)技術(shù),通(tōng)過熒光信號(hào)的實(shí)時監測實(shí)現(xiàn)目標DNA的(dí)定量(liáng)分析。其具體(tǐ)機(jī)製如(rú)下:
探(tàn)針(zhēn)設(shè)計
探針為一(yī)段與(yǔ)環孢子蟲(chóng)目(mù)標序列互(hù)補(bǔ)的寡(guǎ)核苷酸(suān),兩(liǎng)端分別標(biāo)記(jì)熒光報告(gào)基(jī)團(tuán)(如FAM)和(hé)淬(cuì)滅(miè)基(jī)團(如TAMRA)。當探針(zhēn)完(wán)整(zhěng)時(shí),報告基團(tuán)的(dí)
熒光被(bèi)淬滅基(jī)團(tuán)吸收(shōu),無信號(hào)輸(shū)出。
PCR擴(kuò)增與探(tàn)針降解
退火階段(duàn):探針與(yǔ)目(mù)標(biāo)DNA結合,形(xíng)成雜交(jiāo)雙鏈。
延伸(shēn)階段:Taq酶的5'→3'外切酶(méi)活性切(qiē)割(gē)探針,釋放(fàng)報告基(jī)團(tuán),熒光信號(hào)被(bèi)檢(jiǎn)測係(xì)統(tǒng)捕獲。
信(xìn)號累積(jī):每(měi)擴增一條(tiáo)DNA鏈,對應一個熒光(guāng)分子釋放(fàng),信(xìn)號強度(dù)與目標(biāo)DNA量(liáng)呈(chéng)正比。
定量分(fēn)析(xī)
通過監測(cè)熒光(guāng)信號達到閾值(Ct值(zhí))所需(xū)的循(xún)環數(shù),結合標(biāo)準曲綫(xiàn)計算(suàn)初(chū)始(shǐ)模(mó)板(bǎn)濃(nóng)度(dù)。
技(jì)術(shù)優勢(shì)
高(gāo)特異性:探針僅(jǐn)與目標序(xù)列(liè)結合,避(bì)免(miǎn)非特異性(xìng)擴(kuò)增(zēng)幹擾(rǎo)。
高(gāo)靈敏度:可(kě)檢測(cè)低至100拷(kǎo)貝的模(mó)板(bǎn)。
封閉反應:無(wú)需(xū)開蓋操作,減少汙染(rǎn)風(fēng)險(xiǎn)。
與(yǔ)染料法的(dí)區(qū)別
探(tàn)針(zhēn)法通(tōng)過特(tè)異(yì)性探(tàn)針識別目標(biāo)序(xù)列(liè),而染(rǎn)料法(fǎ)(如SYBR Green)僅(jǐn)結合所(suǒ)有(yǒu)雙(shuāng)鏈DNA,特(tè)異性較低(dī)但成本(běn)更低(dī)。
探(tàn)針(zhēn)設(shè)計
探針為一(yī)段與(yǔ)環孢子蟲(chóng)目(mù)標序列互(hù)補(bǔ)的寡(guǎ)核苷酸(suān),兩(liǎng)端分別標(biāo)記(jì)熒光報告(gào)基(jī)團(tuán)(如FAM)和(hé)淬(cuì)滅(miè)基(jī)團(如TAMRA)。當探針(zhēn)完(wán)整(zhěng)時(shí),報告基團(tuán)的(dí)
熒光被(bèi)淬滅基(jī)團(tuán)吸收(shōu),無信號(hào)輸(shū)出。
PCR擴(kuò)增與探(tàn)針降解
退火階段(duàn):探針與(yǔ)目(mù)標(biāo)DNA結合,形(xíng)成雜交(jiāo)雙鏈。
延伸(shēn)階段:Taq酶的5'→3'外切酶(méi)活性切(qiē)割(gē)探針,釋放(fàng)報告基(jī)團(tuán),熒光信號(hào)被(bèi)檢(jiǎn)測係(xì)統(tǒng)捕獲。
信(xìn)號累積(jī):每(měi)擴增一條(tiáo)DNA鏈,對應一個熒光(guāng)分子釋放(fàng),信(xìn)號強度(dù)與目標(biāo)DNA量(liáng)呈(chéng)正比。
定量分(fēn)析(xī)
通過監測(cè)熒光(guāng)信號達到閾值(Ct值(zhí))所需(xū)的循(xún)環數(shù),結合標(biāo)準曲綫(xiàn)計算(suàn)初(chū)始(shǐ)模(mó)板(bǎn)濃(nóng)度(dù)。
技(jì)術(shù)優勢(shì)
高(gāo)特異性:探針僅(jǐn)與目標序(xù)列(liè)結合,避(bì)免(miǎn)非特異性(xìng)擴(kuò)增(zēng)幹擾(rǎo)。
高(gāo)靈敏度:可(kě)檢測(cè)低至100拷(kǎo)貝的模(mó)板(bǎn)。
封閉反應:無(wú)需(xū)開蓋操作,減少汙染(rǎn)風(fēng)險(xiǎn)。
與(yǔ)染料法的(dí)區(qū)別
探(tàn)針(zhēn)法通(tōng)過特(tè)異(yì)性探(tàn)針識別目標(biāo)序(xù)列(liè),而染(rǎn)料法(fǎ)(如SYBR Green)僅(jǐn)結合所(suǒ)有(yǒu)雙(shuāng)鏈DNA,特(tè)異性較低(dī)但成本(běn)更低(dī)。
